Biblioteka liczy ponad 17.000 woluminów, w skład których wchodzą książki, czasopisma i multimedia. Ma ona charakter naukowy, a jej profil jest związany z charakterem Muzeum.
Księgozbiór tworzą publikacje związane m.in. z górnictwem, geologią, muzealnictwem, konserwacją, archeologią, historią, historią sztuki i etnografią. Wśród nich szczególnie cenne to zbiór starodruków (ponad 80 sztuk). Najstarszy z nich to „Kosmografia” Sebastiana Münstera z 1564 r. Istotną częścią zasobu jest księgozbiór przejęty po Bibliotece Salinarnej, działającej przy Żupie Solnej w XIX i na pocz. XX w., liczący ok. 2000 woluminów, często unikalnych tytułów.
Pomoce archiwalne – drukowane katalogi zbiorów:
K. Dziwik, Katalog dokumentów Muzeum Żup Krakowskich z lat 1492-1777, Wieliczka 1979
K. Dziwik, Katalog rękopisów Muzeum Żup Krakowskich z lat 1518-1971, Wieliczka 1988
M. Marynowski, L. Rzepka, Inwentarz Akt Salinarnych Wieliczki i Bochni z lat 1772-1918 Muzeum Żup Krakowskich Wieliczka, Wieliczka 2004